Para su funcionamiento, el Centro de Documentación y Estudios (CDE) cuenta con una dirección general y coordinaciones de las áreas de trabajo que se eligen anualmente en la Asamblea. Los proyectos ejecutados por el CDE tienen coordinaciones específicas, bajo la supervisión de la dirección y de las coordinaciones de áreas.

En el CDE funcionan ectualmente dos áreas de trabajo: el Área Mujer y el Área Sociogremial. Además, se cuenta con una Biblioteca de acceso abierto y gratuito al público y una unidad de apoyo administrativo y contable.